Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smap2Q7TN29 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms