Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GypcQ78HU7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms