Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Mindy1Q76LS9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Mindy1Q76LS9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Mindy1Q76LS9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Mindy1Q76LS9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Mindy1Q76LS9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Mindy1Q76LS9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Mindy1Q76LS9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Mindy1Q76LS9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Mindy1Q76LS9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms