Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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