Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms