Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx13Q6PHS6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx13Q6PHS6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx13Q6PHS6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx13Q6PHS6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx13Q6PHS6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx13Q6PHS6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx13Q6PHS6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx13Q6PHS6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx13Q6PHS6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx13Q6PHS6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx13Q6PHS6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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