Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtifQ6PEE2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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