Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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