Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms