Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx4Q6P1D7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx4Q6P1D7 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms