Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l2Q6KAU8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms