Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms