Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop58Q6DFW4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms