Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pram1Q6BCL1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pram1Q6BCL1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pram1Q6BCL1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pram1Q6BCL1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pram1Q6BCL1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pram1Q6BCL1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pram1Q6BCL1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pram1Q6BCL1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pram1Q6BCL1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pram1Q6BCL1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pram1Q6BCL1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pram1Q6BCL1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pram1Q6BCL1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pram1Q6BCL1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pram1Q6BCL1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pram1Q6BCL1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pram1Q6BCL1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pram1Q6BCL1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms