Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Cd53Q61451 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Cd53Q61451 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Cd53Q61451 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Cd53Q61451 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Cd53Q61451 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Cd53Q61451 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Cd53Q61451 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Cd53Q61451 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms