Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tfap2bQ61313 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms