Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms