Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P4ha1Q60715 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms