Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtprnQ60673 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms