Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms