Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms