Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS3

Drc1, Dynein regulatory complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Drc1Q3USS3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Drc1Q3USS3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc1Q3USS3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms