Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec31aQ3UPL0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms