Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGM2

Nek10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek10Q3UGM2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nek10Q3UGM2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek10Q3UGM2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms