Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LbrQ3U9G9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms