Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hvcn1Q3U2S8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms