Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serac1Q3U213 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms