Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy4Q3TYX8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms