Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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Ccndbp1Q3TVC7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ccndbp1Q3TVC7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ccndbp1Q3TVC7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Ccndbp1Q3TVC7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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