Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trappc10Q3TLI0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms