Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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ptchd1Q14B62 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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ptchd1Q14B62 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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ptchd1Q14B62 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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ptchd1Q14B62 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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ptchd1Q14B62 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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ptchd1Q14B62 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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ptchd1Q14B62 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
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ptchd1Q14B62 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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ptchd1Q14B62 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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