Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Rpusd2Q149F1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rpusd2Q149F1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rpusd2Q149F1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rpusd2Q149F1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rpusd2Q149F1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rpusd2Q149F1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd2Q149F1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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