Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc162pQ0VG85 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms