Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms