Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cntnap5cQ0V8T7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cntnap5cQ0V8T7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cntnap5cQ0V8T7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cntnap5cQ0V8T7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cntnap5cQ0V8T7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntnap5cQ0V8T7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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