Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spata18Q0P557 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms