Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms