Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a2Q07643 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms