Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf3Q07104 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms