Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp2Q06649 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms