Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPINDOCQ05AH6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINDOCQ05AH6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms