Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Sox12Q04890 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox12Q04890 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms