Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcad1Q04692 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms