Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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PrkcqQ02111 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkcqQ02111 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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PrkcqQ02111 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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PrkcqQ02111 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcqQ02111 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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