Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms