Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Serpina1cQ00896 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms