Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms