Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gfra1P97785 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms