Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smyd1P97443 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms