Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9xP70398 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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